Bakom anmälan står länsstyrelsen.
– Vi har skickat åtalsanmälan. I övrigt är det förundersökningssekretess, säger Matts Claesson från naturvårdsenheten vid Länsstyrelsen Östergötland.
Det var i augusti som länsstyrelsen beslutade att stoppa muddringen av Valdemarsviken eftersom vattnet grumlats för mycket av det miljöfarliga bottensedimentet i viken.
Då hävdade länsstyrelsen att kommunen känt till de höga halterna i mer än en månad utan att slå larm till myndigheten.
Valdemarsviks kommun förnekade i sin tur att man mörkat några uppgifter.
Nu är det upp till miljöåklagare i Jönköping att avgöra om en förundersökning ska inledas i ärendet.