Ordern gjordes på tisdagen, samtidigt som världshälsoorganisationen WHO varnade för att pandemin inte går att stoppa.
Australien tillhör de länder som drabbats värst av A/H1N1-viruset. Sammanlagt har 10.000 smittats i landet och 19 personer rapporteras ha avlidit i virusrelaterade sjukdomar.
Oroas över andra vågen
Vaccindoserna väntas inte kunna levereras till Australien förrän i september. Men landets federale hälsochef Jim Bishop sade att man planerar en allmän immunisering redan i oktober, då viruset blivit ”aggressivt” och i allt högre utsträckning drabbar unga och friska personer.
-Vi är oroade över den andra vågen av detta virus, vilken kan bli mycket värre än den första, sade Bishop, som hoppades att läkemedelstillverkarna skulle lyckas leverera vaccinet i tid.