Varför stenstrukturen kollapsade är oklart, men området har drabbat av oväder och stormar.
Maltas premiärminister Joseph Muscat beskriver händelsen som förkrossande, skriver Reuters.
Geologer har länge varnat för att strukturen eroderade snabbt, och myndigheter har bland annat förbjudit besökare från att gå på bågen. Redan 2012 lossnade en stor sten från strukturen som gjorde fönstret större och ökade instabiliteten.
Azurfönstret var populärt bland dykare och turister, speciellt efter att man filmat den populära tv-serien ”Game of thrones” på platsen.