Sundby, som gick ut 31,7 sekunder före Calle Halfvarsson på dagens 35 km långa jaktstart, gick i mål en knapp minut före etappens tvåa Petter Northug.
Halfvarsson gick i mål som fyra och gick miste om viktiga bonussekunder. Han tappar dessutom två placeringar och är fyra i sammandraget.
Svensken ingick i en grupp som försökte plocka in tid på Sundy, men istället tappade klungan.
– Det är synd att vi inte kan hålla högre tempo. Vi tappar för mycket första halvan, säger Halfvarsson.
Vad beror det på?
– Det är lite dåligt samarbete. Man skulle kunna ligga och dra lite mer taktiskt. Att alla hjälper till och drar. Men det är klart att Petter (Northug) och Chris (Jespersen) inte vill dra. Men man hade hoppats att Legkov skulle vara med dragvillig. Men han kanske var trött, säger Halfvarsson.