Ekdal spelade 70 minuter i förlustmatchen mot Bulgarien i går kväll.
Han kom till start trots smärta i ryggen, men lämnade plats för Sebastian Larsson med 20 minuter kvar av matchen.
Mot Vitryssland blir det inga minuter överhuvudtaget.
Det meddelar förbundet i dag.
”Landslagets medicinska team konstaterade att Albin Ekdals skadade rygg inte kommer att hinna rehabiliteras på ett tillräckligt sätt till på söndag”, skriver landslagsledningen i ett uttalande.
Tidigare i dag kallades Isaac Kiese Thelin in som ersättare till avstängde Ola Toivonen.