Neymar inledde på bänken, men redan i halvtid kom han in istället för den centrala mittfältaren Fernandinho.
I den 69:e minuten fick storstjärnan bollen, vände in i plan och satte 1-0 snyggt bakom Danijel Subasic i Kroatiens mål.
2-0 kom i matchens sista spark genom Roberto Firmino. Matchen spelades också på det som till vardags är Firminos hemmaplan, Anfield i Liverpool.
Neymar visar alltså fin form inför VM som för Brasiliens del börjar med match mot Schweiz söndagen den 17 juni. Innan dess ska de generalrepetera mot Österrike nästa söndag.
I VM-gruppen ställs Brasilien mot Schweiz, Costa Rica och Serbien. Här hittar du alla matcher och grupper.