Hon drog hårt i finalen som blev hennes snabbaste lopp med segertiden 3.17,94.
– Jag tänkte att om de ska vara med över krönet så ska de ha fått slita, säger Nilsson om grillningen av konkurrenterna.
Nilsson var på hugget från tidig morgon och vann kvalet på 3.22,07 med över tre sekunder till godo på Hanna Falk som dominerade i Faluns världscuptävling i fredags.
Vann alla fyra loppen i dag
I kvarten, där Nilsson åkte i första heatet, manövrerade hon säkert i snöfallet och vann före Ebba Andersson, en indikation på att det mer var en distansbana med tung kupering och lång åktid på Vitberget i Skellefteå.
I semin var Nilsson lika övertygande. Hon vann enkelt före Jonna Sundling, som vann SM-sprinten de två senaste åren, och vid målgången hade solen brutit igenom.