Mannen hittades av en privatperson i ett vattendrag i Vetlandatrakten på söndagseftermiddagen.
Polisen inledde då en förundersökning om mord alternativt dråp. Området där mannen hittades spärrades av och én teknisk undersökning gjordes under måndagen.
– Det finns omständigheter som gör att vi inte kan utesluta brott, säger Lasse Johansson, presstalesman för polisen i Jönköpings län.
Stort sökpådrag
19-åringen hade varit försvunnen sedan natten mellan lördag och söndag förra veckan då han ska ha befunnit sig i Vetlanda. Ett stort sökpådrag med bland annat hundar och helikopter samt ett hundratal frivilliga från Missing People letade efter honom.
Polisen vill inte nu på måndagen gå ut med mer information i ärendet eftersom det råder förundersökningssekretess.