Under torsdagen ska dock alla kunder ha fått tillbaka de felaktigt dragna pengarna på sitt konto, enligt Nordea.
Den dubbla debiteringen berodde på att någon på banken av misstag tagit emot de elektroniska filerna två gånger.
-Det var den mänskliga faktorn som ställde till det, säger Boo Ehlin, presschef vid Nordea, till TT.