De tre ministrarna var på väg till den årliga säkerhetskonferensen München Security Conference när planet tvingades nödlanda. Totalt 16 passagerare befann sig ombord.
Flygplanet lyfte från Arlanda runt 15.30, men tvingades nödlanda cirka 20 minuter senare sedan något sorts varningslarm utlösts ombord.
Räddningstjänsten kallades till platsen, och konstaterade senare att de inte kunde hitta något fel på flyget.
Fick ställa in panelsamtal
Incidenten gjorde att statsministern fick ställa in sin medverkan i ett panelsamtal med Polens och Frankrikes utrikesministrar, Ukrainas minister för återuppbyggnad och den republikanske senatorn Mitch McConnell.
Kristersson kom till München först sent på fredagskvällen men ska enligt pressekreteraren Hanna Strömberg följa programmet för lördagen och söndagen enligt tidigare upplagt schema.
Även försvarsminister Pål Jonson (M) och Kristerssons nationelle säkerhetsrådgivare Henrik Landerholm deltar vid konferensen.