Mannen är på sannolika skäl misstänkt för allmänfarlig ödeläggelse och försök till mord.
Under häktningsförhandlingen, som hölls under förmiddagen i Nyköpings tingsrätt, lade åklagaren fram teknisk bevisning i form av dna-spår.
– Det är hans dna som har hittats på brottsplatsen men jag vill inte tala om exakt var, säger åklagare Fredrik Beijar.
Själv nekar 24-åringen till alla anklagelser.
Det var i slutet av augusti som en granat kastades in på krogen i centrala Nyköping. En städerska skadades vid explosionen och fick föras till sjukhus.