Enligt polisuppgifter svängde bilföraren in på en tvärgata till Gamla Uppsalagatan när mannen på elsparkcykel kom åkande på en cykelöverfart och träffades.
Ambulans och polis larmades till platsen. Olycksoffret fördes till sjukhus med livshotande skador.
Efter operation beskrivs mannens tillstånd på söndagförmiddagen, i en kommuniké från Akademiska sjukhuset, som allvarligt men stabilt.
Bilföraren misstänks för brott mot väjningsplikten.