Ytterligare en misstänkt gärningsman, som också denne sägs vara från Colombia, dog i en skottväxling med polisen.
Den 59-årige politikern och journalisten Villavicencio, som var en kritisk röst mot korruption, sköts ihjäl i samband med ett valkampanjsmöte i Ecuadors huvudstad Quito på onsdagskvällen, lokal tid. Minst nio andra personer, inklusive poliser, skadades i attacken.
Till följd av mordet har president Guillermo Lasso utlyst undantagstillstånd i landet som ska gälla under 60 dagar. Presidentvalet kommer dock att hållas som planerat den 20 augusti.
Se Fernando Villavicencio hålla sitt sista tal innan mordet, i klippet nedan.
Javascript är avstängt
Javascript måste vara påslaget för att kunna spela video