Kommissionen anser att kravet bryter mot rätten att fritt erbjuda tjänster i EU.
Onsdagens besked kommer efter brevväxling i frågan under flera år.
Parallellt dras Sverige även inför EU:s domstol för att inte ha infört tillräckliga kontroller av säkerhetsregler till havs.
"Sverige har inte lyckats åtgärda de identifierade bristerna och inte heller gjort märkbara framsteg när det gäller att lösa dem", anser kommissionen i ett pressmeddelande.