Olyckan inträffade i Kasai-provinsen på söndagen. De flesta av offren var fripassagerare på godståget.
– Vi har fått fram 24 kroppar, mestadels barn. Men det är en preliminär siffra eftersom vagnarna fortfarande är omkullvälta, säger en polisanställd.
Flera vagnar ska ha fallit ner i vattnet från bron över floden Luembe. När det blev mörkt på kvällen avbröts räddningsinsatsen.
Personerna med de allvarligaste skadorna har tagits till ett sjukhus i staden Kakenge.
– Vi har redan fått in 31 skadade, säger en läkare.
Det här är den tredje tågurspårningen på en månad i landet. Fem personer omkom i en olycka med ett persontåg i februari. Järnvägsolyckor är vanliga i Kongo-Kinshasa, på grund av förfallna spår och ålderdomliga spår.