Det är första gången som viruset H7N2, som vanligen påträffas hos fåglar, har infekterat tamkatter, uppger hälsovårdsmyndigheten i New York.
Symptomen är i allmänhet milda med nysningar, hosta och rinnande ögon och näsa.
Viruset upptäcktes förra månaden hos 45 katter på Manhattan i ett katthem som drivs av Animal Care Center (ACC). Senare spreds smittan till katthärbärgen i Queens och Brooklyn.
Hälsovårdsmyndigheten känner inte till hur katterna har smittats av viruset och hur det kunde spridas så snabbt.
– Vi fortsätter att uppmana New York-borna som har tagit hand om katter från ACC-hem att vara uppmärksamma på symptom hos sina husdjur och vidta lämpliga försiktighetsåtgärder, säger Mary Bassett vid hälsovårdsmyndigheten.