Mer än 50 ambulanser körde i ilfart till olycksplatsen och skadade människor har förts till tre olika sjukhus i regionen.
Det finns uppgifter i lokala medier om dödsoffer efter olyckan, men dessa har inte bekräftats av de egyptiska myndigheterna.
På söndagskvällen meddelade landets myndigheter att minst elva personer har dött till följd av olyckan, rapporterar AP.
Förra månaden miste minst 20 människor livet och nästan 200 skadades när två tåg kolliderade norr om staden Sohag i centrala Egypten.