Även valdeltagandet var högt, 95,2 procent, meddelar Centrala valkommissionen i Astana.
Siffrorna är ännu starkare än förra gången det begav sig. I valet 2011 fick Nazarbajev 96 procent av rösterna.
Till saken hör dock att oppositionen inte ställde upp med några motkandidater.
Den 74-årige metallarbetaren Nazarbajev har styrt oljelandet Kazakstan sedan 1989.