Händelsen hanterades först som en olycka och polisen misstänkte inget brott, men under lördagen omrubricerades händelsen och en förundersökning har inletts.
– Vi kommer att utreda det som vållande till annans död genom arbetsplatsolycka, säger Kim Hild, informatör på polisen i region Syd.
Det var sent i fredags kväll som den polske sjömannen drunknade i samband med övningen Northern Coasts. Sjömannen hamnade i vattnet i Örlogshamnen i Karlskrona och räddningstjänstens dykare hittade honom senare på botten.
Sjömannen transporterades till Blekingesjukhuset, men hans liv gick inte att rädda.
– Vi kommer självklart att stötta polisen fullt ut i deras utredning, säger Carolina Lorentzson Nilsson, informationschef på Marinbasen.