De franska ambassadörerna i USA och Australien kallades hem i förra veckan för konsultationer sedan Australien brutit ett avtal om att bygga franska ubåtar.
I stället ingick landet ett ubåtsavtal samt en säkerhetspakt, ”Aukus”, med USA och Storbritannien.
Macron och Biden ska ha ingående överläggningar för att återuppbygga förtroendet och även mötas i Europa i slutet av oktober, enligt ett uttalande.