Domaren Azmi Ariffin ger ingen förklaring till varför man väljer att fria kvinnan, som suttit häktad i två år misstänkt för inblandning i mordet. Beskedet kom under måndagsförmiddagen lokal tid.
– Jag är överraskad och väldigt glad, säger kvinnan till nyhetsbyrån AP strax efter att hon fick beskedet i Shah Alam-domstolen utanför Kuala Lumpur.
Enligt indonesiska myndigheter blev kvinnan lurad och manipulerad av nordkoreansk underättelsetjänst, uppger AP.
Fler misstänkta
Misstankarna mot en vietnamesisk kvinna och fyra nordkoreanska kvinnor kvarstår. De nordkoreanska kvinnorna är dock försvunna sen mordet och har inte kunnat gripas.
Kvinnorna har uppgivit att de blivit duperade av en grupp nordkoreaner till att tro att de skulle medverka i ett skämtprogram på TV genom att smeta en ofarlig vätska på Kim Jong-Nam, enligt försvarsadvokaterna.
Mördades med nervgift
Kim Jong-Nam mördades på flygplatsen i Kuala Lumpur i februari 2017. En trasa med nervgiftet VX trycktes mot hans ansikte medan han väntade på ett flyg och han dog inom 20 minuter.
Vid tiden för sin död hade Kim Jong-Nam sedan länge ingen kontakt med sin bror och levde i exil i Malaysia där han ibland kritiserade styret i sitt hemland.