Tidigare under onsdagskvällen uppgav expresidentens egen stiftelse att han var på väg att överlämna sig självmant.
”Observera att president Zuma har beslutat att följa arresteringsordern. Han är på väg att överlämna sig till en kriminalvårdsanläggning i KZN” (provinsen Kwazulu-Natal)”, skriver expresidentens stiftelse på Twitter.
Förra veckan dömdes Zuma till 15 månaders fängelse för domstolstrots av landets författningsdomstol, sedan han vägrat att framträda inför en kommission som utreder korruptionsanklagelser mot honom.
En konvoj med bilar, där Zuma tros ha färdats, lämnade expresidentens hem cirka 40 minuter före den tidsfrist som getts honom.