Det var efter ett tips som lankesisk polis och militär slog till mot ett hus i närheten av staden Kalmunai, på Sri Lankas östkust.
När styrkorna närmade sig huset sprängde tre män sig själva till döds och skottlossning utbröt mellan styrkorna, enligt polisen.
– Elden besvarades och styrkorna stormade tillhållet där en stor gömma av sprängmedel har förvarats, säger militärens talesperson Sumith Atapattu i ett uttalande.
Bombmaterial och tusentals kulor hittades
Sammanlagt dog 15 personer i räden. Sex barn och tre kvinnor som befann sig i huset dog i explosionen, men ingen militär eller polis ska ha skadats.
Ytterligare tre män sköts till döds utanför huset. Enligt polisen bar även de på självmordsbomber.
I ett annat hus i samma område, som också uppges vara ett av terroristernas gömställen, hittades tusentals kulor, sprängdeg och material för att tillverka bomber.
Oron stor för nya attentat
Tillslaget ska enligt uppgift ha kopplingar till påskhelgens terrordåd mot flera kyrkor, när självmordsbombare attackerade kyrkor och hotell på Sri Lanka.
I landet är oron nu stor för nya attentat. Muslimer har flytt sina hem i rädsla för hämndattacker och religiösa ledare har uppmanat troende att inte samlas vid kyrkor eller moskéer.
Ärkebiskop Malcolm Ranjith i staden Colombo säger att det inte kommer att hållas några katolska mässor någonstans i landet under söndagen.
Enligt Ranjith har han sett hemliga läckta dokument från säkerhetstjänsten som varnar för nya attacker mot kyrkor.